核酸研究:“垃圾DNA”或可成为诊断感染的利器

2012-04-30 10:31 来源:丁香园 作者:bailangwang
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原来认为非编码RNA(ncRNA)是不重要的“垃圾DNA”,但科学家最近发现其在细胞功能中扮演关键角色。ncRNA的突变与多种疾病相关,比如癌症、孤独症和阿尔茨海默病。

通过应用深度测序技术,Tel Aviv大学Sackler医学院的Noam Shomron博士发现当机体感染病毒时,ncRNA通过释放生物信号来显示病原体的存在。这一发现不仅使研究者能够更全面的理解病原体和机体之间的相互作用,还为科学家对抗感染提供了新思路。该研究发表于Nucleic Acid Research杂志。

病原体和宿主之间的另一战场

Shomron解释道:“当机体感染某种病毒时,如果观察到特定RNA分子增多,我们可以通过治疗来停止或减缓这些分子的增生。”在研究中,一些细胞被感染HIV病毒,而其它细胞没有被感染。研究者应用深度测序仪对ncRNA进行分析,以确定在非编码DNA物质中能否探测到感染。该测序仪在一次实验中可以测定数千万个序列。研究者能够百分之百地分辨出感染和非感染细胞,因为ncRNA释放出显著信号。

这些信号包括细胞中特定ncRNA分子的增多或减少,可能具有生物学意义。他说:“机体感染病原体后,编码和非编码基因相互作用。从一个新的角度来认识病原体和宿主之间的相互作用,使我们能够更好地理解整个过程。而且,通过理解不同病毒感染后ncRNA的反应,我们可以对所有的病原体宣战。

寻找感染的薄弱环节

研究者认为,如果机体感染某种病毒后特定的ncRNA显著增多,则表明该病原体指定了这种ncRNA来帮助其伤害宿主。为了帮助机体抵御感染,用药物来减缓ncRNA分子的增生是一种新颖且有效的方法。

Shomron博士说,这项新发现使研究者能够同时从两个不同的方向研究对抗病毒的疗法,即同时以编码和非编码遗传物质为靶点。他认为ncRNA可以被证明是病原体的薄弱环节。

Shomron博士和他的研究团队研发了一款名为 RandA的新软件,其全称为“ncRNA阅读和分析”软件。它能够演示ncRNA模型并能对深度测序技术获得的数据进行分析。就是这款软件帮助他们发现了病毒感染细胞的特点。

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编辑: jiang

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