将来的某一天，一种肠道细菌的人工合成混合物将替代粪便移植来治疗艰难梭菌（C. difficile）。艰难梭菌是一种可以产生毒素的细菌，在抗生素过量应用的情况下，它将在肠道内大量繁殖。而正常情况下，艰难梭菌是一种维持肠道菌群平衡的肠道正常菌群。
就职于金士顿总医院胃肠道疾病研究组的皇后大学（Queen's University）医学系助理教授Elaine Petrof说：“合成粪便移植技术具有诸多优势，我们既可以决定往里面加入什么，也可以在需要的时候对其成分进行微调、变更，或一定程度的调整。”
Petrof 博士和她的在奎尔夫大学的合作者Emma Allen-Vercoe都相信，由人工合成或“提纯的”细菌制成的粪便化合物可以显著改进粪便移植技术。它可以减少由粪便细菌引起的传染病的风险；内科医生可以调配这种混合物以增加病人的接受度；这种混合物很容易再造；所以，它对医生和病人来说都是一种具有吸引力的“清洁工”式治疗措施。
Allen Vercoe博士是一名专门研究肠道细菌的厌氧微生物学家，其与Petrof博士正在就改进这一治疗措施而进行紧密合作。合成粪便项目的最终目标是提供一种单次给药治疗，结束有复发症状患者的频繁就诊。目前，这一新疗法尚未面世，他们还在完善着此项研究。
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