免疫系统缺乏抵抗力者，如恶性肿瘤，HIV感染和克罗恩病患者，特别容易患病且最应该接受流感和其他疫苗的接种。然而免疫功能低下患者的疫苗接种率却趋于降低，部分原因是因为他们的医生可能会担心疫苗的安全性和有效性。
2013年12月5日，美国感染疾病协会（Infectious Diseases Society of America，IDSA）发布了《2013 年美国感染疾病协会免疫功能低下者疫苗接种临床实践指南，以下简称指南》。该指南在线发表在《临床感染疾病》（Clinical Infectious Diseases）杂志上。指南的目标是减少免疫功能低下患者疫苗接种可预防的感染的发病率和死亡率。
指南的主要制定者Lorry G. Rubin博士，为纽约新海德公园Steven and Alexandra Cohen儿童医学中心的小儿感染性疾病科主任，霍夫斯特拉北岸LIJ医学院儿科教授。制定指南专家组包括成人和儿科的胃肠病学，免疫学，传染病，血液病，肿瘤，风湿病学，干细胞和实体器官移植专家。专家组参考了美国其他的感染病协会的指南制定使用过程，包括系统加权的证据的质量和推荐等级，详细描述了方法，背景和证据总结，确保每个推荐都能在指南全文中找到。而在此之前，推荐很难检索，因为大多数疫苗信息必须单独访问，而不是由病人疾病的范畴确定。
指南主要为临床医师治疗免疫功能低下的孩子和成人患者提供帮助，其包括大多数可用疫苗接种的推荐，从甲肝，麻疹，腮腺炎和风疹及其他儿童接种的流感，到肺炎球菌及带状疱疹疫苗。指南覆盖的患者人群包括：先天性免疫缺陷，艾滋病，肿瘤，实体器官移植（如肾脏和肝脏），干细胞移植，慢性炎性疾病（如类风湿性关节炎和克罗恩病），镰状细胞病和无脾症，人工耳蜗植入和脑脊液泄漏等患者。
特殊推荐包括：①如果可能，应在免疫抑制之前接种疫苗。②活疫苗应至少在免疫抑制前4周接种，避免在免疫抑制起始2周内接种。③灭活疫苗应至少在免疫抑制前2周接种。④大多数免疫功能低下的病人，年龄6个月或更大者，应每年接受流感疫苗接种，但不应接种鼻腔喷雾式的减毒活流感疫苗。⑤流感疫苗不太可能使正在接受强烈化疗或曾在过去6个月内接受抗B细胞抗体治疗的患者受益。⑥根据美国CDC免疫接种实践咨询委员会对儿童和成人或旅行者每年更新的推荐免疫程序，与免疫功能低下患者生活在一起的免疫功能正常人可以安全地接种灭活疫苗。⑦与免疫功能低下患者生活在一起的年龄大于6个月的，如果是健康，未孕，年龄2岁至49岁之间的患者，应每年接种流感疫苗，无论是灭活流感疫苗或减毒活流感疫苗。
指南不能总是考虑患者的个体差异，也不能取代医生对于特定病人或特殊的临床情况的判断。美国传染病学会认为遵守这些推荐准则是自愿的，关于应用的最终决定应由医生根据每个病人的具体情况作出。指南中星号（*）表示推荐的疫苗接种方案与美国疾病预防控制中心免疫实践咨询委员会的推荐相偏离。
