游戏机中常见的一种电脑芯片被英国布里斯托大学的科学家们用来展示流感病毒是如何对达菲和瑞乐沙等抗流感药物产生耐药性的。
布里斯托大学化学学院的 Adrian Mulholland 教授和 Christopher Woods 博士与他们在泰国的同事一起,使用现代图形处理器(GPUs) 模拟了使用以上抗流感药物治疗H1N1时的分子进程。H1N1是2009年新发现的流感菌株,通常被称为“猪流感”。
他们的研究结果发表在《生物化学》杂志上,其中所提出的新的见解能够引领新一代抗流感药物的发展。
H1N1-2009是一种全新的,基于猪、禽类、人类流感病毒基因片段的高适应性病毒。2009年初在它出现的短短几个月内,就造成了21世纪的第一次流感大流行。
抗病毒药物达菲和瑞乐沙,针对神经氨酸酶突起(NA),能够有效地治疗流感。但是随着这些药物的广泛使用,导致神经氨酸酶突起产生了一系列突变,从而降低了药物的有效性。
临床研究显示猪流感病毒神经氨酸酶突起双重突变株IRHY2将瑞乐沙的治疗效果降低了21次,将达菲的治疗效果降低了12374次,也就是说这些药物变得对它无效了。
为了了解瑞乐沙和达菲的疗效为何会因为这种突变下降的如此严重,研究者使用现代图形处理器进行了长期的分子动力学研究(MD) 。
Mulholland教授说:“我们的模拟实验显示IRHY变得对达菲耐药是因为神经氨酸酶突起‘150环’结构的残基与药物之间的氢键丢失。”
“这使得神经氨酸酶突起由封闭结构转变为开放结构。由于药物和活性中心间的静电作用,达菲对开放结构的作用微弱,这使药物失去了作用。”
这些研究表明,可以通过增加神经氨酸酶突起抑制剂和150环残基之间的氢键作用,来维持封闭结构,从而克服耐药性。
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